Cryptic lineages and hybridization in freshwater mussels of the genus Pyganodon (Unionidae) in northeastern North America
Notice bibliographique
Résumé
The distribution of freshwater mussels Pyganodon Crosse and P. Fischer, 1894 traditionally inferred from morphological characters was validated by a genetic characterization of the genus within the Quebec peninsula. Individuals were identified by comparing the sequences from the female mitochondrial genome (COI and 16S) with those of reference individuals, while hybridization was assessed with male mitochondrial (COI and COII) and nuclear genomes (ITS1 and ITS2). The results confirmed most of the previous morphological identifications but revealed unexpected results. Both male and female mitochondrial genomes support the distinction between Pyganodon fragilis (Lamarck, 1819) and Pyganodon cataracta (Say, 1817). However, only one lineage of Pyganodon grandis (Say, 1829), instead of the two expected, was detected in the sampled area. The genetic survey also revealed the presence of two unidentified Pyganodon lineages, previously unreported within the Quebec peninsula. These extremely rare lineages harbour the signature of ancestral hybridizations. Finally, recent divergence and hybridizations make shell characters only partially efficient in discriminating Pyganodon lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».