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Enregistrement W1981093010 · doi:10.1182/blood-2014-08-591370

Mutations in TRNT1 cause congenital sideroblastic anemia with immunodeficiency, fevers, and developmental delay (SIFD)

2014· article· en· W1981093010 sur OpenAlexafffund
Pranesh Chakraborty, Klaus Schmitz‐Abe, Erin K. Kennedy, Hapsatou Mamady, Danielle Durie, Dean R. Campagna, Ashley Lau, Anoop K. Sendamarai, Daniel H. Wiseman, Alison May, Stephen Jolles, Philip Connor, Colin Powell, Matthew M. Heeney, Patricia-Jane Giardina, Robert J. Klaassen, Caroline Kannengiesser, Isabelle Thuret, Alexis A. Thompson, Lino Marques, Stephen Hughes, Denise Bonney, Sylvia S. Bottomley, Robert Wynn, Ronald M. Laxer, Caterina P. Minniti, John Moppett, Victoria Bordon, Michael T. Geraghty, Paul B. M. Joyce, Kyriacos Markianos, Adam D. Rudner, Martin Holčı́k, Mark D. Fleming

Notice bibliographique

RevueBlood · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensConcordia UniversitySickKids FoundationUniversity of TorontoNewborn Screening OntarioChildren's Hospital of Eastern OntarioHospital for Sick ChildrenUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthUniversity of OttawaNational Institute for Social Care and Health ResearchUniversity of WashingtonCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research SocietyOhio State University
Mots-clésSideroblastic anemiaImmunodeficiencyPrimary immunodeficiencyMutationAnemiaMedicineSevere combined immunodeficiencyImmunologyPediatricsBiologyGeneticsInternal medicineGeneImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in genes encoding proteins that are involved in mitochondrial heme synthesis, iron-sulfur cluster biogenesis, and mitochondrial protein synthesis have previously been implicated in the pathogenesis of the congenital sideroblastic anemias (CSAs). We recently described a syndromic form of CSA associated with B-cell immunodeficiency, periodic fevers, and developmental delay (SIFD). Here we demonstrate that SIFD is caused by biallelic mutations in TRNT1, the gene encoding the CCA-adding enzyme essential for maturation of both nuclear and mitochondrial transfer RNAs. Using budding yeast lacking the TRNT1 homolog, CCA1, we confirm that the patient-associated TRNT1 mutations result in partial loss of function of TRNT1 and lead to metabolic defects in both the mitochondria and cytosol, which can account for the phenotypic pleiotropy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations180
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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