Separation of kallikrein 6 glycoprotein subpopulations in biological fluids by anion‐exchange chromatography coupled to ELISA and identification by mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
Kallikrein 6 (KLK6) has been shown to be aberrantly glycosylated in ovarian cancer. Here, we report a novel HPLC anion exchange method, coupled to a KLK6-specific ELISA, capable of differentiating KLK6 glycoform subgroups in biological fluids. Biological fluids were fractionated using anion exchange and resulting fractions were analyzed for KLK6 content by ELISA producing a four-peak elution profile. Using this assay, the KLK6 elution profile and distribution across peaks of a set (n = 7) of ovarian cancer patient matched serum and ascites fluid samples was found to be different than the profile of serum and cerebrospinal fluid (CSF) of normal individuals (n = 7). Glycosylation patterns of recombinant KLK6 (rKLK6) were characterized using tandem mass spectrometry (MS/MS), and found to consist of a highly heterogeneous KLK6 population. This protein was found to contain all of the four diagnostic KLK6 peaks present in the previously assayed biological fluids. The rKLK6 glycoform composition of each peak was assessed by lectin affinity and MS/MS based glycopeptide quantification by product ion monitoring. The combined results showed an increase in terminal alpha 2-6 linked sialic acid in the N-glycans found on KLK6 from ovarian cancer serum and ascites, as opposed to CSF and serum of normal individuals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».