Multidimensional Prognostic Risk Assessment Identifies Association Between IL12B Variation and Surgery in Crohn’s Disease
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The ability to identify patients with Crohn's disease (CD) at highest risk of surgery would be invaluable in guiding therapy. Genome-wide association studies have identified multiple IBD loci with unknown phenotypic consequences. The aims of this study were to: (1) identify associations between known and novel CD loci with early resective CD surgery and (2) develop the best predictive model for time to surgery using a combination of phenotypic, serologic, and genetic variables. METHODS: Genotyping was performed on 1,115 subjects using Illumina-based genome-wide technology. Univariate and multivariate analyses tested genetic associations with need for surgery within 5 years. Analyses were performed by testing known CD loci (n = 71) and by performing a genome-wide association study. Time to surgery was analyzed using Cox regression modeling. Clinical and serologic variables were included along with genotype to build predictive models for time to surgery. RESULTS: Surgery occurred within 5 years in 239 subjects at a median time of 12 months. Three CD susceptibility loci were independently associated with surgery within 5 years (IL12B, IL23R, and C11orf30). Genome-wide association identified novel putative loci associated with early surgery: 7q21 (CACNA2D1) and 9q34 (RXRA, COL5A1). The most predictive models of time to surgery included genetic and clinical risk factors. More than a 20% difference in frequency of progression to surgery was seen between the lowest and highest risk groups. CONCLUSIONS: Progression to surgery is faster in patients with CD with both genetic and clinical risk factors. IL12B is independently associated with need and time to early surgery in CD patients and justifies the investigation of novel and existing therapies that affect this pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».