Abstract IA12: Regulation of the RNF168-dependent response to DNA double-strand breaks
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The chromatin-based response to DNA double-strand breaks (DSBs) is characterized by the accumulation of DNA repair factors and DNA damage signaling molecules within a large domain that surrounds the lesion. This response is largely dependent on ATM-dependent phosphorylation but also on chromatin ubiquitylation. Indeed, the RNF8 and RNF168 E3 ubiquitin ligases are necessary for the accumulation of proteins such as 53BP1, BRCA1 and RAD18 at sites of DNA damage. The critical importance of this pathway is manifested by the observation that biallelic mutations in the RNF168 gene results in an ataxia-telangiectasia-like syndrome referred to as RIDDLE. We are interested in understanding how this pathway is regulated and how ubiquitin-dependent protein interactions orchestrate the hierarchy of protein recruitment at sites of DNA lesions. I will present our current understanding on the regulation and organization of this signaling cascade and in particular, I will focus my presentation on addressing how the pathway underpinned by RNF168 is regulated during the course of the cell cycle. Citation Format: Alexandre Orthwein, Daniel Durocher. Regulation of the RNF168-dependent response to DNA double-strand breaks. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Cancer Susceptibility and Cancer Susceptibility Syndromes; Jan 29-Feb 1, 2014; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(23 Suppl):Abstract nr IA12. doi:10.1158/1538-7445.CANSUSC14-IA12
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».