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Enregistrement W1981225291 · doi:10.1515/bc.2006.159

A novel proteolytically processed CDP/Cux isoform of 90 kDa is generated by cathepsin L

2006· article· en· W1981225291 sur OpenAlexafffund
Brigitte Goulet, Mary Truscott, Alain Nepveu

Notice bibliographique

RevueBiological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Breast Cancer Research AllianceBreast Cancer Alliance
Mots-clésGene isoformCathepsin AMolecular biologyCathepsin DMutantCathepsin ECathepsin HChemistryBiologyGeneBiochemistryCathepsin OEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Cut-like genes code for multiple isoforms of the CDP/Cux transcription factor. The full-length protein contains four DNA-binding domains: Cut repeats 1, 2 and 3 (CR1, CR2 and CR3) and the Cut homeodomain (HD). The p75 isoform is expressed from an mRNA that is initiated within intron 20 and contains only CR3 and HD. The p110 isoform is generated by proteolytic processing by cathepsin L and contains CR2, CR3 and HD. In the present study, we show that an additional isoform of 90 kDa is expressed in many cell lines of epithelial origin. Mapping experiments with deletion mutants indicated that the N-terminus of p90 is located upstream of CR2, between amino acids 918 and 938. Indeed, p90 and p110 displayed similar DNA-binding and transcriptional activities. The p90 isoform, like p110, was found to be generated by proteolytic processing. The steady-state level of both p90 and p110 correlated with the level of cathepsin L activity. Importantly, co-expression with a cathepsin L mutant that is initiated at downstream AUG sites also stimulated the generation of p90 and p110. These results strongly suggest that p90, like p110, is generated by cathepsin L isoforms that are devoid of a signal peptide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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