The 2003 West Nile virus United States epidemic: the America's Blood Centers experience
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: A detailed assessment of West Nile virus (WNV) yield is needed to evaluate the effectiveness of the WNV nucleic acid amplification technology (NAT) screening implemented in 2003. STUDY DESIGN AND METHODS: WNV NAT screening and donation data were compiled from members of America's Blood Centers, which collect nearly 50 percent of the US blood supply. WNV RNA screening was performed with either the Gen-Probe/Chiron Procleix transcription-mediated amplification assay or the Roche TaqScreen polymerase chain reaction. Results of alternate NAT and WNV immunoglobulin M (IgM) antibody assays conducted on index and follow-up samples were obtained from test manufacturers. Presumed WNV positivity was based on NAT repeat reactivity of the individual index donation whereas confirmatory status was based on additional IgM testing of the index donation and NAT and serology testing of follow-up samples. RESULTS: From July through October 2003, 2.5 million donations were screened for WNV RNA. Of 877 NAT-reactive donations (screening positivity rate of 3.5 per 10,000 units), 430 (49%) were confirmed positive, whereas 68 (8%) lacking follow-up data remained presumed positive. The sensitivity and positive predictive value of a presumed viremic result relative to final confirmatory status were 92 and 99 percent, respectively. WNV activity was highest in the central plains with prevalence per 10,000 peaking August 1 to 15 in Colorado (67.7) and South Dakota (77.5) and August 16 to 31 in Wyoming (74.1) and North Dakota (102.0). CONCLUSIONS: WNV screening interdicted many viremic units, thereby reducing transfusion-transmitted infections. This study demonstrates that a national collaborative effort facilitates timely surveillance of blood donor infectious disease prevalence rates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».