MICROBIAL ECOLOGY AND BIOFILMS IN THE TAPHONOMY OF SOFT TISSUES
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Authigenic mineralization of embryos (and potentially other soft-bodied organisms) requires first stabilization of cells against rapid self-autolytic destruction, and secondly a role for bacterial biofilms that preserve rather than destructively consume tissue. We predict that the ecology of the second stage in preservation will depend on environmental effects on the bacterial species present, coupled with mutual interactions between the bacteria themselves. We have created a simple experimental model made up of two antagonistic marine bacterial species, tested on a taphonomic target of autolysis-inhibited killed marine embryos. Pseudoalteromonas tunicata forms a three-dimensional preserving biofilm with killed embryos, whereas P. luteoviolacea destroys embryo tissue. Our model system allows controlled laboratory tests of microbial interactions under taphonomic conditions selected to test inferred paleoenvironments present in Lagerstätten. We varied environmental conditions one at a time, and observed the taphonomic outcome for killed embryos in the presence of each species alone, and with both species present in direct competition. Parameters tested include temperature, pH, oxygen level, salinity, and nutrient state. Pseudoalteromonas tunicata was robust in generating preserving biofilm pseudomorphs over a wide range of conditions. In competition, P. luteoviolacea destruction dominated in most conditions. However, we identified conditions of temperature, pH, and salinity where P. luteoviolacea grows poorly and preservation by P. tunicata dominates. Elevated external nutrients reduced the fidelity of P. tunicata pseudomorphs. In low oxygen, P. tunicata physiology was altered and it switched to become a destroyer, dramatically showing the extent to which environment can determine taphonomic outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».