P01-05. Rapid perforin upregulation dominates the HIV-specific CD8 T cell response during acute HIV-infection
Notice bibliographique
Résumé
Recent dogma suggests that CD8 T cell ''polyfunctionality'' is essential for control of HIV, however none of the commonly measured functions are likely responsible for clearing infected target cells. During acute HIV infection, when HIV-specific CD8 T cells are thought to resolve peak viremia, an effector response has not been formally demonstrated. PBMC from 23 acutely infected HIV patients were stimulated with pools of overlapping peptides encompassing all HIV open reading frames. A panel of antibodies directed against cell surface and intracellular entities was employed to stain for HIV-specific CD8 T cells by flow cytometry. Functionality was assessed by the ability to upregulate perforin, IFN-γ, IL-2, TNF-α, MIP-1β, and CD107a simultaneously. Nineteen of 23 (82.6%) subjects mounted an HIV-specific CD8 T cell response of at least 3 functions against a minimum 1 peptide pool, however none of the cells were capable of performing all functions. While MIP-1β and CD107a were ubiquitous functions, and TNF-α and IFN-γ were consistently expressed, IL-2 production was rarely observed. In contrast, the majority of subjects (17/19; 89.5%) demonstrated a pronounced ability to upregulate perforin upon HIV-specific stimulation. Even in the absence of highly polyfunctional responses perforin upregulation was reliably detected; 16/17 (94.1%) perforin responders displayed a strong perforin+degranulation+ subset. The HIV-specific CD8 T cells capable of perforin upregulation were largely effector (CCR7-CD45RO-) or effector memory (CCR7-CD45RO+), and most of these cells co-expressed CD57. Rather than the absolute number of functions an HIV-specific CD8 T cell can perform, it is the quality of the functions that correlates to potential control HIV replication. Being that rapid perforin upregulation is a direct marker of in vivo cytotoxicity, its prevalence during acute HIV infection, even in concert with only degranulation, provides compelling evidence for a critical role of CD8 T cells in the control of acute HIV infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,193 | 0,053 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».