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Enregistrement W1981277258 · doi:10.1186/1742-4690-6-s3-p5

P01-05. Rapid perforin upregulation dominates the HIV-specific CD8 T cell response during acute HIV-infection

2009· article· en· W1981277258 sur OpenAlexaff
George Makedonas, Ian Frank, D Guidonis, MA Ostrowski, Weinhold Kj, MR Betts

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDownregulation and upregulationHuman immunodeficiency virus (HIV)PerforinImmunologyCD8VirologyAntibodyImmune systemBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent dogma suggests that CD8 T cell ''polyfunctionality'' is essential for control of HIV, however none of the commonly measured functions are likely responsible for clearing infected target cells. During acute HIV infection, when HIV-specific CD8 T cells are thought to resolve peak viremia, an effector response has not been formally demonstrated. PBMC from 23 acutely infected HIV patients were stimulated with pools of overlapping peptides encompassing all HIV open reading frames. A panel of antibodies directed against cell surface and intracellular entities was employed to stain for HIV-specific CD8 T cells by flow cytometry. Functionality was assessed by the ability to upregulate perforin, IFN-γ, IL-2, TNF-α, MIP-1β, and CD107a simultaneously. Nineteen of 23 (82.6%) subjects mounted an HIV-specific CD8 T cell response of at least 3 functions against a minimum 1 peptide pool, however none of the cells were capable of performing all functions. While MIP-1β and CD107a were ubiquitous functions, and TNF-α and IFN-γ were consistently expressed, IL-2 production was rarely observed. In contrast, the majority of subjects (17/19; 89.5%) demonstrated a pronounced ability to upregulate perforin upon HIV-specific stimulation. Even in the absence of highly polyfunctional responses perforin upregulation was reliably detected; 16/17 (94.1%) perforin responders displayed a strong perforin+degranulation+ subset. The HIV-specific CD8 T cells capable of perforin upregulation were largely effector (CCR7-CD45RO-) or effector memory (CCR7-CD45RO+), and most of these cells co-expressed CD57. Rather than the absolute number of functions an HIV-specific CD8 T cell can perform, it is the quality of the functions that correlates to potential control HIV replication. Being that rapid perforin upregulation is a direct marker of in vivo cytotoxicity, its prevalence during acute HIV infection, even in concert with only degranulation, provides compelling evidence for a critical role of CD8 T cells in the control of acute HIV infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,736
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
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