MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1981294952 · doi:10.1074/jbc.m112.384438

Proteomic Profiling of Androgen-independent Prostate Cancer Cell Lines Reveals a Role for Protein S during the Development of High Grade and Castration-resistant Prostate Cancer

2012· article· en· W1981294952 sur OpenAlexafffund
Punit Saraon, Natasha Musrap, Daniela Creţu, George S. Karagiannis, Ihor Batruch, Christopher R. Smith, Andrei P. Drabovich, Dominique Trudel, Theodorus van der Kwast, Colm Morrissey, Keith Jarvi, Eleftherios P. Diamandis

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity Health NetworkLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthUniversity Health NetworkNational Cancer InstituteUniversity of WashingtonLucas Foundation
Mots-clésProstate cancerLNCaPDU145ProstateAndrogenAndrogen deprivation therapyCancer researchMedicineInternal medicineOncologyAndrogen receptorCancerHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Androgen deprivation constitutes the principal therapy for advanced and metastatic prostate cancers. However, this therapeutic intervention usually results in the transition to a more aggressive androgen-independent prostate cancer. The elucidation of molecular alterations during the progression to androgen independence is an integral step toward discovering more effective targeted therapies. With respect to identifying crucial mediators of this transition, we compared the proteomes of androgen-independent (PC3, DU145, PPC1, LNCaP-SF, and 22Rv1) and androgen-dependent (LNCaP and VCaP) and/or normal prostate epithelial (RWPE) cell lines using mass spectrometry. We identified more than 100 proteins that were differentially secreted in the androgen-independent cell lines. Of these, Protein S (PROS1) was elevated in the secretomes of all of the androgen-independent prostate cancer cell lines, with no detectable secretion in normal and androgen-dependent cell lines. Using quantitative PCR, we observed significantly higher (p < 0.05) tissue expression levels of PROS1 in prostate cancer samples, further indicating its importance in prostate cancer progression. Similarly, immunohistochemistry analysis revealed elevation of PROS1 in high grade prostate cancer (Gleason grade ≥ 8), and further elevation in castration-resistant metastatic prostate cancer lesions. We also observed its significant (p < 0.05) elevation in high grade prostate cancer seminal plasma samples. Taken together, these results show that PROS1 is elevated in high grade and castration-resistant prostate cancer and could serve as a potential biomarker of aggressive disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetCell Adhesion Molecules ResearchTravaux en français237 207