Formation of isodialuric acid lesion within DNA oligomers via one-electron oxidation of 5-hydroxyuracil: characterization, stability and excision repair
Notice bibliographique
Résumé
5-Hydroxyuracil is a major oxidized nucleobase that can be generated by the action of (*)OH radical and one-electron oxidants. The latter modified base that exhibits a low ionization potential is highly susceptible to further degradation upon exposure to various oxidants. Emphasis was placed in this work on the formation and characterization of one-electron oxidation products of 5-hydroxyuracil within DNA fragments of defined sequence. For this purpose, 5-hydroxyuracil containing single- and double-stranded oligonucleotides of various lengths were synthesized and then exposed to the oxidizing action of iridium salts. Isodialuric acid was found to be formed almost quantitatively by a one-electron oxidation mechanism for which relevant information was inferred from a freeze-quenched ESR study. Information on the stability of isodialuric acid thus formed and its conversion products in aqueous solutions was also gained from experiments performed at acidic, neutral and alkali pH's. Moreover, biochemical features dealing with the substrate specificity of several bacterial and yeast base excision repair enzymes to remove isodialuric acid from site-specifically modified DNA fragments were determined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».