Light is required for low-CO<sub>2</sub>-mediated induction of transcripts encoding components of the CO<sub>2</sub>-concentrating mechanism in the cyanobacterium <i>Synechococcus elongatus</i>: analysis by quantitative reverse transcription - polymerase chain reaction
Notice bibliographique
Résumé
Photosynthetic efficiency in cyanobacteria is improved under conditions of inorganic carbon (Ci) limitation by the induction of a CO2-concentrating mechanism (CCM) that elevates the CO2 concentration around the primary carboxylase ribulose-1,5-bisphosphate carboxylaseoxygenase (Rubisco) in the carboxysome. The molecular details of low-Ci sensing in relation to regulation of CCM induction in cyanobacteria are not presently known. We have applied a quantitative reverse transcription polymerase chain reaction technique to monitor the abundance of key CCM-related transcripts in Synechococcus elongatus under a variety of experimental conditions with the aim of probing the conditions required for CCM induction. Despite preliminary evidence for strong induction of cmpA, sbtA, and chpY transcripts in the dark under low Ci in Synechococcus elongatus, subsequent experiments in which contaminating levels of room light during harvest were eliminated demonstrated that light is required for induction of these transcripts. However, the requirement for light for significant accumulation of CCM-related transcripts was very modest and well below the light level required to induce measurable net photosynthetic electron transport. Brief treatments with weak monochromatic light under low Ci were sufficient to cause significant accumulation of transcripts in Synechococcus elongatus relative to cells held in continuous darkness.Key words: CO2-concentrating mechanism, cyanobacteria, photosynthesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».