A genome-wide telomere screen in yeast: The long and short of it all
Notice bibliographique
Résumé
Following the identification of the first Saccharomyces cerevisiae gene whose mutation leads to ever-shorter telomeres ( EST1 ) (1), several dozen genes have been identified that play critical roles in telomere length regulation. Their functions can be loosely categorized into those that affect the action of the telomerase enzyme (e.g., EST1, EST2, EST3, TLC1, KU70 / KU80, PIF1 , and the MRX complex) (reviewed in ref. 2); those that affect stability of telomerase components such as the telomerase RNA TLC1 (e.g., Sm proteins, MTR10 ) (3, 4); and those that play a role in the regulation of telomeric heterochromatin, replication, or end protection (e.g., CDC13, STN1, TEN1, RAP1, RIF1, RIF2, MEC1 , and TEL1 ) (reviewed in ref. 2). Although these studies have vastly increased our understanding of telomere integrity and replication, a comprehensive telomere length analysis of the collection of haploid yeast strains containing a marked deletion at each known nonessential ORF has not yet been reported (5). In an article in this issue of PNAS, Askree et al. (6) are the first authors to publish such a genome-wide screen for deletions that affect average telomere length in S. cerevisiae . In an admirable feat, DNA was prepared from 4,852 strains comprising the haploid …
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».