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Enregistrement W1981459273 · doi:10.1128/jvi.78.3.1063-1068.2004

Herpes Simplex Virus Virion Host Shutoff Protein: Immune Evasion Mediated by a Viral RNase?

2004· review· en· W1981459273 sur OpenAlexafffund
James R. Smiley

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2004
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyVirologyEvasion (ethics)Herpes simplex virusImmune systemVirusHost (biology)ImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Herpes simplex virus type 1 (HSV-1) is the prototypical member of the Herpesviridae, a large family of enveloped DNA viruses that infect diverse metazoans. It is also the defining example of the Alphaherpesvirinae, the neurotropic subfamily of herpesviruses. Like all herpesviruses, HSV displays both lytic and latent modes of interaction with its natural human host. Primary infection of epithelial cells produces the lytic response—virus replication followed by cell death. Progeny virus particles then infect adjacent sensory neurons, establishing a lifelong latent interaction. The latent viral genome is maintained in an extrachromosomal state in which only a restricted portion of the genome is transcribed. Latent genomes occasionally reactivate into the lytic cycle, producing a limited amount of progeny virus that gives rise to secondary infections of the epithelial sites enervated by the latently infected neurons. HSV executes a complex genetic program during lytic infection (reviewed in reference 47). Expression of most cellular genes is strongly suppressed, and three temporal classes of viral genes are sequentially activated in a regulatory cascade. Five viral immediate-early (IE) genes are expressed first, and four of these (ICP0, ICP4, ICP22, and ICP27) encode regulatory proteins that stimulate expression of the viral early (E) and late (L) genes. The E genes are activated next, giving rise to proteins required for replication of the viral genome. Viral DNA replication then ensues, augmenting IE-dependent expression of the L genes that encode the structural components of the virion. HSV differs from many other nuclear DNA viruses in that some of its key regulatory polypeptides are delivered into the host cell by the infecting virus particle. These virion regulators are located in the viral tegument—the space between the envelope and the nucleocapsid—and as such are injected into the newly infected cell immediately upon fusion of the viral envelope with the host cell plasma membrane. These proteins are therefore strategically poised to influence the very earliest events in the viral replication cycle. In the best-known case, the abundant tegument protein VP16 activates transcription of the viral IE genes, thereby contributing to the initial launch of the lytic program of gene expression (reviewed in reference 17). The tegument also contains vhs, the virion host shutoff protein encoded by HSV gene UL41. vhs is an mRNA-specific RNase that triggers rapid shutoff of host cell protein synthesis, disruption of preexisting polyribosomes, and degradation of host mRNAs in the absence of de novo viral gene expression (reviewed in reference 55). Here I summarize our present understanding of the mechanism of vhs action and discuss recent studies that point to intriguing roles in viral pathogenesis and immune evasion. Space limitations preclude an exhaustive review of the earlier literature; I therefore seek the indulgence of my colleagues and refer the interested reader to a recent review (55) and the introductory sections of two recent articles (9, 10) for more details. Unless otherwise stated below, vhs refers to the UL41 gene product of HSV-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations244
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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