Polygenic control of hepatocarcinogenesis in Copenhagen × F344 rats
Notice bibliographique
Résumé
Cop and CFF1 rats exhibit resistance to hepatocarcinogenesis, associated with high rates of remodeling of neoplastic lesions. We have mapped hepatocarcinogenesis susceptibility, resistance and remodeling loci affecting the number, volume and volume fraction of neoplastic nodules induced by the "resistant hepatocyte" model in male CFF2 rats. Three loci in significant linkage with the number or volume of nonremodeling lesions were identified on chromosomes 1, 4 and 18. Suggestive linkage with number or volume fraction of total, nonremodeling or remodeling lesions was found for 7 loci on chromosomes 1, 2, 13, 14 and 15. All of these loci showed significant allele-specific effects on the phenotypic traits. We also detected by analysis of variance 19 2-way interactions inducing phenotypic effects not predictable on the basis of the sum of separate effects. These novel epistatic loci were in significant linkage with the number and/or volume of total, nonremodeling or remodeling nodules. These data indicate that susceptibility to hepatocarcinogenesis in Cop rats is controlled by a complex array of genes with several gene-gene interactions and that different genetic mechanisms control remodeling and nonremodeling liver nodules. Frequent deregulation in human liver cancer of genes positioned in chromosomal segments syntenic to rat susceptibility/resistance loci suggests some similarities between the genetic mechanisms involved in hepatocarcinogenesis in rats and humans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».