MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1981487162 · doi:10.1002/em.1036

Further characterization and validation of <i>gpt</i> delta transgenic mice for quantifying somatic mutations in vivo

2001· article· en· W1981487162 sur OpenAlexaff
Roy R. Swiger, Lidia Cosentino, Kenichi Masumura, Takehiko Nohmi, John A. Heddle

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransgeneMutagenBiologyGenetically modified mouseGeneticsIn vivoLocus (genetics)Molecular biologyGeneMutantMutagenesisSomatic cellMutationEthylnitrosoureaCarcinogen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The utility of any mutation assay depends on its characteristics, which are best discovered using model mutagens. To this end, we report further on the characteristics of the lambda-based gpt delta transgenic assay first described by Nohmi et al. ([1996]: Environ Mol Mutagen 28:465-470). Our studies show that the gpt transgene responds similarly to other transgenic loci, specifically lacZ and cII, after treatment with acute doses of N-ethyl-N-nitrosourea (ENU). Because genetic neutrality is an important factor in the design of treatment protocols for mutagenicity testing, as well as for valid comparisons between different tissues and treatments, a time-course study was conducted. The results indicate that the gpt transgene, like cII and lacZ, is genetically neutral in vivo. The sensitivities of the loci are also equivalent, as evidenced by spontaneous mutant frequency data and dose- response curves after acute treatment with 50, 150, or 250 mg/kg ENU. The results are interesting in light of transgenic target size and location and of host genetic background differences. Based on these studies, protocols developed for other transgenic assays should be suitable for the gpt delta. Additionally, a comparison of the gpt and an endogenous locus, Dlb-1, within the small intestine of chronically treated animals (94 microg/mL ENU in drinking water daily) shows differential accumulation of mutations at the loci during chronic exposure. The results further support the existence of preferential repair at endogenous, expressed genes relative to transgenes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEnvironmental and Molecular MutagenesisMême sujetDNA Repair MechanismsTravaux en français237 207