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Enregistrement W1981487679 · doi:10.1080/00268970500417242

Thermodynamic functions of conformational changes I. A comparative first principles study of 1,2-disubstituted ethanes

2006· article· en· W1981487679 sur OpenAlexaff
Béla Viskolcz, Szilárd N. Fejer, Milán Szöri, Imre G. Csizmadia

Notice bibliographique

RevueMolecular Physics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueFree Radicals and Antioxidants
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryEnthalpyFunnelConformational isomerismThermodynamicsReaction coordinateConformational entropyEntropy (arrow of time)Computational chemistryMoleculePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The conformational changes of ethane and disubstituted ethanes, X–CH2–CH2–X, where X were hydrogen isotopes of higher masses, −F atoms and −CH3 groups, were investigated by CBS-4M and MP2/6-311G(d,p) computational levels. Thermodynamic functions such as ΔH, ΔG and S were computed along the approximate reaction coordinate of conformational changes. The lowest frequency associated with the rotation about the central C–C bond was omitted along the whole reaction path. The thermodynamic functions were continuous in the case when only 3N–7 internal degrees of freedom were taken into consideration. Identical results were obtained using projected frequency calculations in the surroundings of rotational transition states. The effect of the mass and electronic difference on the entropy of the two key compounds (X = F and X = CH3) were separated and assessed. The periodicity of reaction coordinates determined the periodicity of the thermodynamic functions. The second derivatives of the potential energy functions had a shape similar to the entropy functions. The enthalpy was plotted as a function of entropy and rotational reaction coordinate. The concept of ‘entropy funnel’ used by protein chemists was recognized even in the cases of the simple compounds investigated. We concluded that the bottom of the entropy funnel could correspond to the gauche conformers, in accordance with the concept of protein folding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,416

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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