Thermodynamic functions of conformational changes I. A comparative first principles study of 1,2-disubstituted ethanes
Notice bibliographique
Résumé
The conformational changes of ethane and disubstituted ethanes, X–CH2–CH2–X, where X were hydrogen isotopes of higher masses, −F atoms and −CH3 groups, were investigated by CBS-4M and MP2/6-311G(d,p) computational levels. Thermodynamic functions such as ΔH, ΔG and S were computed along the approximate reaction coordinate of conformational changes. The lowest frequency associated with the rotation about the central C–C bond was omitted along the whole reaction path. The thermodynamic functions were continuous in the case when only 3N–7 internal degrees of freedom were taken into consideration. Identical results were obtained using projected frequency calculations in the surroundings of rotational transition states. The effect of the mass and electronic difference on the entropy of the two key compounds (X = F and X = CH3) were separated and assessed. The periodicity of reaction coordinates determined the periodicity of the thermodynamic functions. The second derivatives of the potential energy functions had a shape similar to the entropy functions. The enthalpy was plotted as a function of entropy and rotational reaction coordinate. The concept of ‘entropy funnel’ used by protein chemists was recognized even in the cases of the simple compounds investigated. We concluded that the bottom of the entropy funnel could correspond to the gauche conformers, in accordance with the concept of protein folding.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».