Proteomic profile of an acute partial bladder outlet obstruction
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Partial bladder outlet obstruction (pBOO) is a ubiquitous problem in urology. From posterior urethral valves to prostatic hypertrophy, pBOO results in significant morbidity and mortality. However, the pathophysiology is not completely understood. Proteomics uses mass spectrometry to accurately quantify change in tissue protein concentration. Therefore, we have applied proteomic analysis to a rodent model to assess for protein changes after a surgically induced pBOO. We hypothesize that proteomic analysis after an acute obstruction will determine the most prevalent initial protein response and, potentially, novel molecular pathways. METHODS: Sprague Dawley rats underwent a surgically induced pBOO (n = 3 per group) for 3, 7, or 14 days. Bladders were assessed for weight and urodynamic parameters. Proteomics used liquid-chromatography based mass spectrometry. Polymerase chain reaction (PCR) was performed on tissue samples to confirm increased mRNA transcription. RESULTS: Bladder weight and capacity increased over the experimental period, but no changes were seen in bladder pressure. Statistically significant increases in protein quantities were seen in 3 proteins related to endoplasmic reticulum stress: GRP-78 (3.66-fold), RhoA (1.90-fold), and RhoA-GDP (1.95-fold), and 2 cytoskeleton molecules: actin (1.7-fold) and tubulin a/b (3.01-fold). Decorin and lumican, members of the small leucine rich proteoglycan (SLRP) family, were also elevated (0.35- and 0.34-fold, respectively). Real-time PCR data confirmed protein elevation. CONCLUSION: Our experiment confirms that molecular changes occur very soon after the initiation of pBOO, and implicates several molecular pathways. We believe these insights may provide insight into novel prevention and treatment strategies targeted at the pathophysiology of pBOO.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».