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Enregistrement W1981502202 · doi:10.1021/bi8005913

TROSY-Based NMR Evidence for a Novel Class of 20S Proteasome Inhibitors

2008· article· en· W1981502202 sur OpenAlexaff
Remco Sprangers, Xiao‐Ming Li, Xinliang Mao, John L. Rubinstein, Aaron D. Schimmer, Lewis E. Kay

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensSickKids FoundationPrincess Margaret Cancer CentreHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteasomeMG132ChemistryProteasome inhibitorBortezomibProteolysisBiochemistryChloroquineLeupeptinBiophysicsCell biologyEnzymeBiologyProteaseMultiple myeloma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The proteasome plays a central role in maintaining cellular homeostasis, in controlling the cell cycle, in removing misfolded proteins that can be toxic, and in regulating the immune system. It is also an important target for novel anticancer drugs, such as bortezomib, a potent inhibitor that has been used successfully in the treatment of multiple myeloma. Here, we show that the antimalaria drug chloroquine inhibits proteasome function in eukaryotic cell extracts and in preparations of purified 20S archaeal proteasome from Thermoplasma acidophilium. Methyl-TROSY-based NMR spectroscopy experiments conducted with the 670 kDa 20S proteasome localize chloroquine binding to regions between the alpha and beta subunits of the alpha-beta-beta-alpha barrel-like structure, approximately 20 A from the proteolytic active sites in this 7-fold symmetric molecule. Complementary amide TROSY experiments that provide further probes of proteasome-inhibitor interactions were performed on a novel 180 kDa single-ring construct containing only alpha subunits, the proper assembly of which was confirmed by electron microscopy. In contrast to the chloroquine-proteasome interaction described here, all previously reported inhibitors of the proteasome, including MG132, bind the catalytic region directly. Consistent with the NMR chemical shift perturbation data reported here that place chloroquine binding distal from sites of proteolysis, we show that MG132 and chloroquine can bind the proteasome simultaneously, further establishing that they exploit two completely separate binding pockets. Our data thus establish a novel class of proteasome inhibitor that functions via a mechanism distinct from binding to active sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,898

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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