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Enregistrement W1981620289 · doi:10.1074/jbc.m111649200

Zinc Binding to the NH2-terminal Domain of the Wilson Disease Copper-transporting ATPase

2002· article· en· W1981620289 sur OpenAlexafffund
Michael DiDonato, Jingyan Zhang, Lawrence Que, Bibudhendra Sarkar

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBrookhaven National LaboratoryArgonne National LaboratoryBasic Energy SciencesNational Center for Research ResourcesUniversity of TorontoU.S. Department of EnergyOffice of ScienceNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésCopperWilson's diseaseTerminal (telecommunication)ATPaseZincCopper metabolismChemistryDiseaseBiochemistryMedicineInternal medicineComputer scienceEnzymeTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the Wilson disease copper transporting, P-type ATPase lead to the accumulation of toxic levels of copper in the liver, brain, and kidney causing extensive tissue damage and eventual death. The NH(2)-terminal domain ( approximately 70 kDa), which contains six copies of the heavy metal-associated repeat GMT/HCXXC, is also able to bind zinc. We have used circular dichroism (CD) and x-ray absorption spectroscopy (XAS) to characterize zinc binding to the NH(2)-terminal metal-binding domain. These studies have revealed that zinc is able to bind to this domain with a stoichiometry of 6:1, and upon binding, induces conformational changes in the NH(2)-terminal domain. These conformational changes are completely different from those previously observed for copper binding to the domain and lead to an overall loss of secondary structure in the domain. The XAS spectra indicate that zinc is ligated primarily by nitrogen atoms and therefore has low affinity for the heavy metal-associated repeats where copper has been shown to bind. The differences between zinc and copper binding may serve as the basis for the metal-ion mediated regulation of the ATPase in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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