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Enregistrement W1981838264 · doi:10.1104/pp.113.230052

Multiple Rice MicroRNAs Are Involved in Immunity against the Blast Fungus <i>Magnaporthe oryzae</i>

2013· article· en· W1981838264 sur OpenAlexfundno aff
Yan Li, Yuangen Lu, Yi Shi, Liang Wu, Yongju Xu, Fu Huang, Xiaoyi Guo, Yong Zhang, Jing Fan, Ji‐Qun Zhao, Hongyu Zhang, Peizhou Xu, Jian‐Min Zhou, Xianjun Wu, Pingrong Wang, Wenming Wang

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsChinese Academy of Agricultural SciencesChinese Academy of Sciences
Mots-clésPyriculariaBiologyOryza sativaMagnaportheGeneFungusMagnaporthe griseaPlant disease resistanceGenetically modified ricePathogenmicroRNAGene expressionMicrobiologyGeneticsTransgeneBotanyGenetically modified crops

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) are indispensable regulators for development and defense in eukaryotes. However, the miRNA species have not been explored for rice (Oryza sativa) immunity against the blast fungus Magnaporthe oryzae, the most devastating fungal pathogen in rice production worldwide. Here, by deep sequencing small RNA libraries from susceptible and resistant lines in normal conditions and upon M. oryzae infection, we identified a group of known rice miRNAs that were differentially expressed upon M. oryzae infection. They were further classified into three classes based on their expression patterns in the susceptible japonica line Lijiangxin Tuan Hegu and in the resistant line International Rice Blast Line Pyricularia-Kanto51-m-Tsuyuake that contains a single resistance gene locus, Pyricularia-Kanto 51-m (Pikm), within the Lijiangxin Tuan Hegu background. RNA-blot assay of nine of them confirmed sequencing results. Real-time reverse transcription-polymerase chain reaction assay showed that the expression of some target genes was negatively correlated with the expression of miRNAs. Moreover, transgenic rice plants overexpressing miR160a and miR398b displayed enhanced resistance to M. oryzae, as demonstrated by decreased fungal growth, increased hydrogen peroxide accumulation at the infection site, and up-regulated expression of defense-related genes. Taken together, our data indicate that miRNAs are involved in rice immunity against M. oryzae and that overexpression of miR160a or miR398b can enhance rice resistance to the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations422
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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