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Enregistrement W1981884865 · doi:10.1210/jc.2011-3000

Activation of Cyclic AMP Signaling Leads to Different Pathway Alterations in Lesions of the Adrenal Cortex Caused by Germline PRKAR1A Defects versus Those due to Somatic GNAS Mutations

2012· article· en· W1981884865 sur OpenAlexaff
Madson Q. Almeida, Monalisa Ferreira Azevedo, Paraskevi Xekouki, Eirini I. Bimpaki, Anélia Horvath, Michael T. Collins, Lefkothea Karaviti, George Jeha, Nisan Bhattacharyya, Chris Cheadle, Tonya Watkins, Isabelle Bourdeau, Maria Nesterova, Constantine A. Stratakis

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone Tumor Diagnosis and Treatments
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésGNAS complex locusWnt signaling pathwayInternal medicineEndocrinologyBiologyFocal adhesionSignal transductionCancer researchGs alpha subunitMAPK/ERK pathwayMcCune–Albright syndromeMedicineCell biologyGeneticsGeneG proteinHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT: The overwhelming majority of benign lesions of the adrenal cortex leading to Cushing syndrome are linked to one or another abnormality of the cAMP or protein kinase pathway. PRKAR1A-inactivating mutations are responsible for primary pigmented nodular adrenocortical disease, whereas somatic GNAS activating mutations cause macronodular disease in the context of McCune-Albright syndrome, ACTH-independent macronodular hyperplasia, and, rarely, cortisol-producing adenomas. OBJECTIVE AND DESIGN: The whole-genome expression profile (WGEP) of normal (pooled) adrenals, PRKAR1A- (3) and GNAS-mutant (3) was studied. Quantitative RT-PCR and Western blot were used to validate WGEP findings. RESULTS: MAPK and p53 signaling pathways were highly overexpressed in all lesions against normal tissue. GNAS-mutant tissues were significantly enriched for extracellular matrix receptor interaction and focal adhesion pathways when compared with PRKAR1A-mutant (fold enrichment 3.5, P < 0.0001 and 2.1, P < 0.002, respectively). NFKB, NFKBIA, and TNFRSF1A were higher in GNAS-mutant tumors (P < 0.05). Genes related to the Wnt signaling pathway (CCND1, CTNNB1, LEF1, LRP5, WISP1, and WNT3) were overexpressed in PRKAR1A-mutant lesions. CONCLUSION: WGEP analysis revealed that not all cAMP activation is the same: adrenal lesions harboring PRKAR1A or GNAS mutations share the downstream activation of certain oncogenic signals (such as MAPK and some cell cycle genes) but differ substantially in their effects on others.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,619
Score d'incertitude au seuil0,424

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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