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Enregistrement W1982006837 · doi:10.1139/o09-014

Coordinate Gα13 and Wnt6-β-catenin signaling in F9 embryonal carcinoma cells is required for primitive endoderm differentiation

2009· article· en· W1982006837 sur OpenAlexafffundvenue
Roman Krawetz, Gregory M. Kelly

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Illinois at Chicago
Mots-clésEndodermWnt signaling pathwayRHOACell biologyBiologyRetinoic acidSignal transductionBeta-cateninEmbryonal carcinomaCellular differentiationCell cultureGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mouse F9 embryonal carcinoma cell line is ideally suited to study the epithelial-to-mesenchymal transition accompanying the differentiation of primitive to parietal extraembryonic endoderm. In F9 cells, the application of exogenous agents including retinoic acid or activation of signal transduction cascades downstream of G-proteins triggers widespread changes in gene expression and leads to the formation of primitive endoderm. The epithelial-to-mesenchymal transition is completed and parietal endoderm develops as of result of increasing PKA activity in primitive endoderm cells. Expression of a constitutively active form of Galpha13(Q226L) is sufficient to induce F9 cells into parietal endoderm and a model is emerging that a signaling axis linking G-protein signaling to RhoA and the ERM protein moesin is required for differentiation. In this study, we found that expression of either p115RhoGEF or a constitutively active, GTPase-deficient form of RhoA(L63) promoted primitive, but not parietal, endoderm formation. The overexpression of Galpha13(Q226L) or p115RhoGEF, but not Rho(L63), caused beta-catenin to translocate to the nucleus. Surprisingly, the stimulation of the Wnt-beta-catenin pathway was accompanied by nuclear beta-catenin and primitive endoderm formation, even when a dominant negative was used to block the signaling axis at the level of p115RhoGEF or when ROCK activity was inhibited using the pharmacological agent Y-27632. Together, results indicate that the coordinate signaling by two independent pathways, one involving canonical Wnt-beta-catenin activation of target genes and the other with Galpha13 signaling to ERM proteins to modulate cytoarchitectural changes, is required during the retinoic acid induced differentiation of F9 cells to primitive endoderm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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