Identification of Human GATA-2 Gene Distal IS Exon and Its Expression in Hematopoietic Stem Cell Fractions
Notice bibliographique
Résumé
Transcription factor GATA-2 is essential for the proper function of hematopoietic stem cells and progenitors. Two first exons/promoters have been found in the mouse GATA-2 gene, and a distal IS promoter shows activity specific to hematopoietic progenitors and neural tissues. To ascertain whether the two-promoter system is also utilized in the human GATA-2 gene, we isolated and analyzed a P1 phage clone containing this gene. The nucleotide sequence of the human GATA-2 gene 5' flanking region was determined over 10 kbp, and a human IS exon was identified in the locus through sequence comparison analysis with that of the mouse GATA-2 IS exon. RNA blotting and reverse-transcribed PCR analyses identified a transcript that starts from the IS exon in human leukemia-derived cell lines. The IS-originated transcript was also identified in CD34-positive bone marrow and cord blood mononuclear cells, which are recognized as clinically important hematopoietic stem cell-enriched fractions. Phylogenic comparison of the human and mouse GATA-2 gene sequences revealed several regions in the locus that exhibit high sequence similarity. These results demonstrate that the GATA-2 gene regulatory machinery is conserved among vertebrates. The fact that the human IS promoter is active in the hematopoietic stem cell/progenitor fraction may be an important clue for the design of a vector system that can specifically express various genes in hematopoietic stem cells and progenitors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».