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Enregistrement W1982120218 · doi:10.1074/jbc.m002814200

Multiple Regulatory Domains Control IRF-7 Activity in Response to Virus Infection

2000· article· en· W1982120218 sur OpenAlexafffund
Rongtuan Lin, Yaël Mamane, John Hiscott

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensMcGill UniversityTerry Fox Research Institute
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCancer Research SocietyMcGill University
Mots-clésTransactivationBiologyGeneInterferonAmino acidInterferon regulatory factorsTranscription (linguistics)Interferon-stimulated geneCell biologyMolecular biologyImmunoprecipitationTranscription factorRegulation of gene expressionChemokineGeneticsInnate immune systemImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent studies implicate the interferon regulatory factors (IRF), IRF-3 and IRF-7, as key activators of Type 1 interferon genes, as well as the RANTES (regulated on activation normal T cell expressed) chemokine gene. Both IRF-3 and IRF-7 are regulated in part by virus-induced C-terminal phosphorylation, leading to nuclear translocation, stimulation of DNA binding, and transcriptional activities. Structure-function studies with IRF-7 suggested a complex organization of the C-terminal region, with a constitutive activation domain located between amino acids 150-246, an accessory inducibility region at the very end of IRF-7 between amino acids 467 and 503, and an inhibitory region (amino acids 341-467) adjacent to the C-terminal end that interferes with transactivation. Furthermore, an element that increases basal and virus-inducible activity is located between amino acids 278 and 305. A transcriptionally active form of IRF-7 was also generated by substitution of Ser-477 and Ser-479 residues with the phosphomimetic Asp. IRF-7, particularly IRF-7(S477D/S479D), was a strong transactivator of type I interferon and RANTES chemokine gene expression. Unlike wild type IRF-3, IRF-7 overexpression was able to stimulate inteferon gene expression in the absence of virus infection. Using tagged versions of IRF-7 and IRF-3, the formation of homo- and heterodimers was detected by co-immunoprecipitation. These results demonstrate that IRF-3 and IRF-7 transcription factors possess distinct structural characteristics that impart complementary rather than redundant functional roles in cytokine gene activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations241
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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