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Characterization of IFN-γ regulation of the complement factor B gene in macrophages

2001· article· en· W1982175547 sur OpenAlexaff
Yong Huang, Peter M. Krein, Brent W. Winston

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Immunology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyBiologyResponse elementElectrophoretic mobility shift assayPromoterOligonucleotideReporter geneBinding siteTransfectionInterferon gammaMutantMutagenesisSTAT1Transcription factorDNAGeneGene expressionIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Complement factor B (Bf) is involved in the activation of the alternative complement cascade. Bf is induced by IFN-gamma; however, the mechanisms of Bf gene regulation have not been well characterized in general, and not in macrophages specifically. Northern analysis reveals that IFN-gamma induces a dose- and time-dependent increase in Bf mRNA expression in primary macrophages and macrophage cell lines. MH-S cells transfected with reporter constructs containing truncated regions of the Bf promoter reveal that IFN-gamma responsiveness lies between -154 and -53 bp on the Bf promoter. This region of the Bf promoter contains both an IFN-gamma-activation site (GAS) and an interferon-stimulated response element (ISRE). Site-directed mutagenesis of the GAS binding site or the ISRE binding site in this region of the Bf promoter partially inhibits IFN-gamma responsiveness. Mutagenesis of both the GAS and ISRE cis elements totally abrogates IFN-gamma responsiveness of the Bf promoter. Electrophoretic mobility shift assays reveal nuclear binding complexes involving both Bf-GAS and Bf-ISRE oligonucleotide sequences upon IFN-gamma stimulation. In competition assays, both Bf-GAS and Bf-ISRE oligonucleotides, but not mutant Bf-GAS nor mutant Bf-ISRE oligonucleotides, compete for the DNA binding. Supershift analysis reveals that Stat1-GAS and IRF-1-ISRE nuclear binding complexes contribute to induction of Bf by IFN-gamma. Western analysis confirms an IFN-gamma-stimulated increase in tyrosine phosphorylation of Stat1. These findings suggest that both GAS and ISRE cis binding sites have an additive effect on IFN-gamma-stimulated Bf gene expression and that both are required for full expression of Bf by IFN-gamma. Stat1 and IRF-1 take part in IFN-gamma-stimulated Bf gene induction in macrophages through their respective cis binding elements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,501
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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