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Enregistrement W1982186227 · doi:10.1371/journal.pone.0040956

Biotinidase is a Novel Marker for Papillary Thyroid Cancer Aggressiveness

2012· article· en· W1982186227 sur OpenAlexaff
Anthony K.-C. So, Jasbir Kaur, Ipshita Kak, Jasmeet Assi, Christina MacMillan, Ranju Ralhan, Paul G. Walfish

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiotinidase deficiencyThyroid cancerMedicineInternal medicineThyroidPathologyPapillary thyroid cancerCancerEndocrinologyStage (stratigraphy)OncologyBiologyNewborn screening

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biotinidase was identified in secretome analysis of thyroid cancer cell lines using proteomics. The goal of the current study was to analyze the expression of biotinidase in thyroid cancer tissues and fine needle aspiration (FNA) samples to evaluate its diagnostic and prognostic potential in thyroid cancer. Immunohistochemical analysis of biotinidase was carried out in 129 papillary thyroid cancer (PTC, 34 benign thyroid tissues and 43 FNA samples and correlated with patients' prognosis. Overall biotinidase expression was decreased in PTC compared to benign nodules (p = 0.001). Comparison of aggressive and non-aggressive PTC showed decrease in overall biotinidase expression in the former (p = 0.001). Loss of overall biotinidase expression was associated with poor disease free survival (p = 0.019, Hazards ratio (HR) = 3.1). We examined the effect of subcellular compartmentalization of nuclear and cytoplasmic biotinidase on patient survival. Decreased nuclear expression of biotinidase was observed in PTC as compared to benign tissues (p<0.001). Upon stratification within PTC, nuclear expression was reduced in aggressive as compared to non-aggressive tumors (p<0.001). Kaplan-Meier survival analysis showed significant association of loss of nuclear biotinidase expression with reduced disease free survival (p = 0.014, HR = 5.4). Cytoplasmic biotinidase expression was reduced in aggressive thyroid cancers in comparison with non-aggressive tumors (p = 0.002, Odds ratio (OR) = 0.29) which was evident by its significant association with advanced T stage (p = 0.003, OR = 0.28), nodal metastasis (p<0.001, OR = 0.16), advanced TNM stage (p<0.001, OR = 0.21) and extrathyroidal extension (p = 0.001, OR = 0.23). However, in multivariate analysis extrathyroidal extension emerged as the most significant prognostic marker for aggressive thyroid carcinomas (p = 0.015, HR = 12.8). In conclusion, loss of overall biotinidase expression is a novel marker for thyroid cancer aggressiveness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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