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Enregistrement W1982261704 · doi:10.1099/mic.0.060988-0

The suhB gene of Burkholderia cenocepacia is required for protein secretion, biofilm formation, motility and polymyxin B resistance

2012· article· en· W1982261704 sur OpenAlexaff
Roberto Rosales-Reyes, M. Soledad Saldías, Daniel Aubert, Omar M. El-Halfawy, Miguel A. Valvano

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBurkholderia cenocepaciaMicrobiologyBiologyBurkholderia cepacia complexPolymyxin BMutantSecretionBurkholderiaBiofilmPolymyxinGeneBacteriaAntibioticsGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Burkholderia cenocepacia is a member of the Burkholderia cepacia complex (Bcc), a group of Gram-negative opportunistic pathogens that cause severe lung infections in patients with cystic fibrosis and display extreme intrinsic resistance to antibiotics, including antimicrobial peptides. B. cenocepacia BCAL2157 encodes a protein homologous to SuhB, an inositol-1-monophosphatase from Escherichia coli, which was suggested to participate in post-transcriptional control of gene expression. In this work we show that a deletion of the suhB-like gene in B. cenocepacia (ΔsuhB(Bc)) was associated with pleiotropic phenotypes. The ΔsuhB(Bc) mutant had a growth defect manifested by an almost twofold increase in the generation time relative to the parental strain. The mutant also had a general defect in protein secretion, motility and biofilm formation. Further analysis of the type II and type VI secretion systems (T2SS and T6SS) activities revealed that these secretion systems were inactive in the ΔsuhB(Bc) mutant. In addition, the mutant exhibited increased susceptibility to polymyxin B but not to aminoglycosides such as gentamicin and kanamycin. Together, our results demonstrate that suhB(Bc) deletion compromises general protein secretion, including the activity of the T2SS and the T6SS, and affects polymyxin B resistance, motility and biofilm formation. The pleiotropic effects observed upon suhB(Bc) deletion demonstrate that suhB(Bc) plays a critical role in the physiology of B. cenocepacia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil0,381

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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