A pharmacogenetics study of the human glucuronosyltransferase UGT1A4
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: UGT1A4 is primarily expressed in the liver and exhibits catalytic activities for various drugs. Amongst the few UGT1A4 polymorphisms evaluated, studies support the alteration of UGT1A4-mediated glucuronidation by a few variations including the Pro²⁴Thr and Leu⁴⁸Val variants (referred to as UGT1A4*2 and *3). METHODS: We therefore investigated genetic mechanisms that might contribute to interindividual variation in UGT1A4 expression and activity. The UGT1A4 gene was sequenced from -4963 bp relative to the ATG to 2000 bp after the first exon in 184 unrelated Caucasians and African-Americans. RESULTS: We identified a large number of genetic variations, including 13 intronic, 39 promoter, as well as 14 exonic polymorphisms, with 10 that lead to amino-acid changes. Of the nucleotide variations found in the -5 kb promoter region, five are located in the proximal region (first 500 bp), and positioned in putative HNF-1 and OCT-1 binding sites. Four of these variants, placed at -163, -219, -419 and -463, are in complete linkage disequilibrium with the Leu⁴⁸Val coding region variant and with several variants in the upstream region of the promoter. Transient transfections of reference and variant promoter constructs (from position -500 to +1) in different cell lines with or without co-expression of HNF-1 and/or OCT-1 showed limited effect of these variations. CONCLUSION: Additional functional studies on promoter variants are still required to predict their potential influence on UGT1A4 expression in vivo. Besides, several coding variants significantly modified the enzyme kinetics for tamoxifen and Z-4-hydroxytamoxifen (Val⁴⁸, Asp⁵⁰, Gln⁵⁶, Phe¹⁷⁶, Asn²⁵⁰, Leu²⁷⁶) and are expected to have a potential in vivo effect.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle