Comparative analysis of virulence and resistance profiles of<i>Salmonella</i>Enteritidis isolates from poultry meat and foodborne outbreaks in northern Jordan
Notice bibliographique
Résumé
This study was conducted to isolate Salmonella Enteritidis from poultry samples and compare their virulence and antibiotic resistance profiles to S. Enteritidis isolated from outbreaks in northern Jordan. Two hundred presumptive isolates were obtained from 302 raw poultry samples and were subjected to further analysis and confirmation. A phylogenic tree based on 16S rRNA sequencing was constructed and selected isolates representing each cluster were further studied for their virulence in normal adult Swiss white mice. The most virulent strains were isolated from poultry samples and had an LD 50 of 1.55 × 10 (5) CFU, while some of the outbreak isolates were avirulent in mice. Antibiotic resistance profiling revealed that the isolates were resistant to seven of eight antibiotics screened with each isolate resistant to multiple antibiotics (from two to six). Of the poultry isolates, 100%, 88.9%, 77.8%, 66.7%, and 50% showed resistance to nalidixic acid, ciprofloxacin, ampicillin, cephalothin, and cefoperazone, respectively. Two outbreak isolates were sensitive to all tested antibiotics, while 71.4% were resistant to cefoperazone and only 28.6% showed resistance to nalidixic acid. Salmonella outbreak isolates were genetically related to poultry isolates as inferred from the 16S rRNA sequencing, yet were phenotypically different. Although outbreak strains were similar to poultry isolates, when tested in the mouse model, some of the outbreak isolates were highly virulent while others were avirulent. This might be due to a variation in susceptibility of the mouse to different S. Enteritidis isolates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».