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Enregistrement W1982612733 · doi:10.1111/j.1574-6941.2012.01447.x

Microbialite genetic diversity and composition relate to environmental variables

2012· article· en· W1982612733 sur OpenAlexaff
Carla M. Centeno, Pierre Legendre, Yislem Beltrán, Rocío Alcántara‐Hernández, Ulrika E. Lidström, Matthew N. Ashby, Luisa I. Falcón

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDiversity (politics)Composition (language)Genetic diversityEvolutionary biologyEcologyAnthropologyEnvironmental healthPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microbialites have played an important role in the early history of life on Earth. Their fossilized forms represent the oldest evidence of life on our planet dating back to 3500 Ma. Extant microbialites have been suggested to be highly productive and diverse communities with an evident role in the cycling of major elements, and in contributing to carbonate precipitation. Although their ecological and evolutionary importance has been recognized, the study of their genetic diversity is yet scanty. The main goal of this study was to analyse microbial genetic diversity of microbialites living in different types of environments throughout Mexico, including desert ponds, coastal lagoons and a crater-lake. We followed a pyrosequencing approach of hypervariable regions of the 16S rRNA gene. Results showed that microbialite communities were very diverse (H' = 6-7) and showed geographic variation in composition, as well as an environmental effect related to pH and conductivity, which together explained 33% of the genetic variation. All microbialites had similar proportions of major bacterial and archaeal phyla.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,606
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,004
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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