Protein Biomarkers in Serum of Pediatric Patients with Severe Traumatic Brain Injury Identified by ICAT–LC-MS/MS
Notice bibliographique
Résumé
This report is a feasibility study on the utility of gel-free proteomics in identifying peripheral biomarkers of brain injury. The study was performed in six pediatric patients admitted to the intensive care unit for severe traumatic brain injury (TBI). Serum samples collected at admission (less than 8 h after injury) were used for determining the levels of S100beta by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and for proteomics analyses. Serum samples were depleted of high abundant albumin and immunoglobulin, and were compared to a pooled reference from several healthy individuals. After labeling and separation on an ionic column, six different serum fractions were analyzed using Isotope-Coded Affinity Tag (ICAT), followed by tandem mass spectrometry (MS/MS) protein sequencing and identification. Ninety-five unique, differentially expressed proteins were identified, including several with a likely brain origin. Several proteins with pattern similarity to S100beta identified by hierarchical clustering could be considered for evaluation in a larger patient sample as potential peripheral markers of TBI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».