MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1982819654 · doi:10.1071/fp07228

Functional analysis of lactate dehydrogenase during hypoxic stress in Arabidopsis

2008· article· en· W1982819654 sur OpenAlexaff
Rudy Dolferus, Mark Wolansky, Rebecka T. Carroll, Yo Miyashita, Kathleen P. Ismond, Allen G. Good

Notice bibliographique

RevueFunctional Plant Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant responses to water stress
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesArizona Biomedical Research Commission
Mots-clésBiologyArabidopsisFermentationLactic acidLactic acid fermentationLactate dehydrogenaseBiochemistryPyruvate decarboxylaseAnaerobic exerciseAlcohol dehydrogenaseMutantEthanolGeneEnzymeGeneticsBacteriaPhysiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During waterlogging conditions plants switch from aerobic respiration to anaerobic fermentation to cope with the lack of available oxygen. Plants have two main fermentation pathways: ethanol and lactic acid fermentation. In this paper we carry out a functional analysis of the Arabidopsis lactate dehydrogenase gene, LDH1. Our results indicate that LDH1, like some other anaerobic genes, is expressed in a root-specific manner and is affected by a variety of abiotic stresses (hypoxia, drought, cold) and mechanical wounding. Functional analysis of LDH1 was carried out using transgenic Arabidopsis overexpressing the gene (35S promoter) and a T-DNA knockout line. Overexpression of LDH1 resulted in improved survival of low oxygen stress conditions in roots but not in shoots. Increased lactic acid fermentation also resulted in significantly higher activities of pyruvate decarboxylase (PDC). Knockout mutants of LDH1 showed reduced survival under low oxygen conditions and PDC activity levels were not changed compared with the wild type. Our data suggest that there is an interdependency between the lactic and ethanol fermentation pathways and that lactic acid fermentation may play a role in stimulating ethanol fermentation and improving plant survival. We show also that Arabidopsis plants are able to exude lactate efficiently into the medium, preventing it accumulating to toxic levels in the cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations95
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFunctional Plant BiologyMême sujetPlant responses to water stressTravaux en français237 207