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Enregistrement W1982831087 · doi:10.1021/bi0518693

Composition of pH-Sensitive Triad in C-Lobe of Human Serum Transferrin. Comparison to Sequences of Ovotransferrin and Lactoferrin Provides Insight into Functional Differences in Iron Release

2005· article· en· W1982831087 sur OpenAlexaff
Peter J. Halbrooks, Anthony M. Giannetti, Joshua S. Klein, Pamela J. Björkman, J. R. Larouche, Valerie C. Smith, Ross T. A. MacGillivray, Stephen J. Everse, Anne B. Mason

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésOvotransferrinChemistryTransferrinBiochemistryEndocytosisAlanineLactoferrinReceptorTransferrin receptorLysineBiophysicsAmino acidBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transferrins (TF) are a family of bilobal glycoproteins that tightly bind ferric iron. Each of the homologous N- and C-lobes contains a single iron-binding site situated in a deep cleft. Human serum transferrin (hTF) serves as the iron transport protein in the blood; circulating transferrin binds to receptors on the cell surface, and the complex is internalized by endocytosis. Within the cell, a reduction in pH leads to iron release from hTF in a receptor-dependent process resulting in a large conformational change in each lobe. In the hTF N-lobe, two critical lysines facilitate this pH-dependent conformational change allowing entry of a chelator to capture the iron. In the C-lobe, the lysine pair is replaced by a triad of residues: Lys534, Arg632, and Asp634. Previous studies show that mutation of any of these triad residues to alanine results in significant retardation of iron release at both pH 7.4 and pH 5.6. In the present work, the role of the three residues is probed further by conversion to the residues observed at the equivalent positions in ovotransferrin (Q-K-L) and human lactoferrin (K-N-N) as well as a triad with an interchanged lysine and arginine (K534R/R632K). As expected, all of the constructs bind iron and associate with the receptor with nearly the same K(D) as the wild-type monoferric hTF control. However, interesting differences in the effect of the substitutions on the iron release rate in the presence and absence of the receptor at pH 5.6 are observed. Additionally, titration with KCl indicates that position 632 must have a positively charged residue to elicit a robust rate acceleration as a function of increasing salt. On the basis of these observations, a model for iron release from the hTF C-lobe is proposed. These studies provide insight into the importance of charge and geometry of the amino acids at these positions as a partial explanation for differences in behavior of individual TF family members, human serum transferrin, ovotransferrin, and lactoferrin. The studies collectively highlight important features common to both the N- and C-lobes of TF and the critical role of the receptor in iron release.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,208
Score d'incertitude au seuil0,608

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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