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Enregistrement W1982850154 · doi:10.1074/jbc.m102872200

The Role of CDP in the Negative Regulation ofCXCL1 Gene Expression

2001· article· en· W1982850154 sur OpenAlexaff
Chaitanya S. Nirodi, Jessie Hart, Punita Dhawan, Nam-Sung Moon, Alain Nepveu, Ann Richmond

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésGene expressionRegulation of gene expressionGeneBiologyGeneticsCell biologyComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CXC chemokine, melanoma growth stimulatory activity/growth-regulated protein, CXCL1 is an important modulator of inflammation, wound healing, angiogenesis, and tumorigenesis. Transcription of CXCL1 is regulated through several cis-acting elements including Sp1, NF-kappa B, and an element that lies immediately upstream of the NF-kappa B element, the immediate upstream region (IUR). A transcription element data base search indicated that the IUR element contains a binding site for the transcriptional repressor, human CUT homeodomain protein/CCAAT displacement protein (CDP). It is shown here that in electrophoretic mobility shift assays, complexes obtained with the IUR oligonucleotide probe are supershifted by anti-CDP antibodies and that a CDP polypeptide containing a high affinity DNA binding domain binds to the sequence GGGATCGATC in the IUR element. In Southwestern blot analyses, oligonucleotides containing the wild-type IUR sequence, but not a mutant oligonucleotide with substitutions in the GGGATCGATC sequence, bind a 170--180-kDa protein. Furthermore, overexpression of the CDP protein blocks CXCL1 promoter activity in reporter gene assays, whereas overexpression of an antisense CDP construct leads to a significant increase in CXCL1 promoter activity. Mutations in the IUR element, which map in the putative CDP-binding site, inhibit the binding of CDP to the IUR element and favor increased transcription from the CXCL1 promoter. Based on these results, we propose that transcriptional regulation of the CXCL1 gene is mediated in part by CDP, which could play an important role in inflammatory processes and tumorigenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,265

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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