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Enregistrement W1982859547 · doi:10.1001/archopht.125.1.128

Analyses of a Novel L130F Missense Mutation in FOXC1

2007· article· en· W1982859547 sur OpenAlexaff
Yoko Ito

Notice bibliographique

RevueArchives of Ophthalmology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationMutationGeneticsBiologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To understand how the novel L130F mutation, found in 2 patients with Axenfeld-Rieger syndrome, disrupts function of the forkhead box C1 protein (FOXC1). METHODS: Sequencing DNA from patients with Axenfeld-Rieger syndrome identified a novel missense mutation that results in an L130F substitution in the FOXC1 gene. Site-directed mutagenesis was used to introduce the L130F mutation into the FOXC1 complementary DNA. The level of L130F protein expression was determined by means of immunoblotting. We determined the mutant protein's ability to localize to the nucleus, bind DNA, and transactivate a reporter construct. RESULTS: The FOXC1 L130F mutant protein is expressed at levels similar to those of wild-type FOXC1. The L130F protein, however, migrated at an apparent reduced molecular weight compared with the wild-type protein, suggesting that the mutant and wild-type proteins may be differentially phosphorylated. The L130F protein also had a significantly impaired capacity to localize to the nucleus, bind DNA, and transactivate reporter genes. CONCLUSIONS: The disease-causing L130F mutation further demonstrates that helix 3 of the forkhead domain is important for the FOXC1 protein to properly localize to the nucleus, bind DNA, and activate gene expression. CLINICAL RELEVANCE: The inability of FOXC1 to function owing to the L130F mutation provides further insight into how disruptions in the FOXC1 gene lead to human Axenfeld-Rieger syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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