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Enregistrement W1982928299 · doi:10.1139/w06-068

Expression regulation of the endochitinase-encoding gene<i>sechi44</i>from the mycoparasite<i>Stachybotrys elegans</i>

2006· article· en· W1982928299 sur OpenAlexafffundvenue
Danielle C. Morissette, Philippe Séguin, Suha Jabaji

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueStudies on Chitinases and Chitosanases
Établissements canadiensMcGill UniversitySte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMicrobiologyGene expressionGeneChitinaseRhizoctonia solaniExtracellularRegulation of gene expressionTranscription (linguistics)Carbon sourceChitinMolecular biologyBotanyCell biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The regulation of the gene encoding the extracellular chitinase sechi44 produced by the mycoparasite Stachybotrys elegans was studied using real-time quantitative reverse-transcription polymerase chain reaction. Alteration of sechi44 expression was observed when S. elegans was in interaction with its host, Rhizoctonia solani, and also when the mycoparasite was grown on minimal media amended with different carbon and nitrogen sources. Direct contact with R. solani leading to mycoparasitism significantly up-regulated the expression of sechi44, although the analysis showed that sechi44 was constitutively expressed but at substantially lower levels. In addition, the study of sechi44 over 12 days showed that its expression followed a cyclical pattern with peaks every 2 days, which suggests that this gene has a role not only in mycoparasitism but also in growth. The addition of external carbon sources, such as N-acetylglucosamine, chitin, and R. solani cell wall (simulated mycoparasitism), triggered an increase in the expression of sechi44, which varied with time and carbon source. Among the carbon sources examined, N-acetylglucosamine induced the highest increase in sechi44 transcript levels. The addition of high concentrations of glucose and ammonium triggered a decrease of sechi44 expression, suggesting that sechi44 is subject to glucose and ammonium repression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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