Expression regulation of the endochitinase-encoding gene<i>sechi44</i>from the mycoparasite<i>Stachybotrys elegans</i>
Notice bibliographique
Résumé
The regulation of the gene encoding the extracellular chitinase sechi44 produced by the mycoparasite Stachybotrys elegans was studied using real-time quantitative reverse-transcription polymerase chain reaction. Alteration of sechi44 expression was observed when S. elegans was in interaction with its host, Rhizoctonia solani, and also when the mycoparasite was grown on minimal media amended with different carbon and nitrogen sources. Direct contact with R. solani leading to mycoparasitism significantly up-regulated the expression of sechi44, although the analysis showed that sechi44 was constitutively expressed but at substantially lower levels. In addition, the study of sechi44 over 12 days showed that its expression followed a cyclical pattern with peaks every 2 days, which suggests that this gene has a role not only in mycoparasitism but also in growth. The addition of external carbon sources, such as N-acetylglucosamine, chitin, and R. solani cell wall (simulated mycoparasitism), triggered an increase in the expression of sechi44, which varied with time and carbon source. Among the carbon sources examined, N-acetylglucosamine induced the highest increase in sechi44 transcript levels. The addition of high concentrations of glucose and ammonium triggered a decrease of sechi44 expression, suggesting that sechi44 is subject to glucose and ammonium repression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».