Development of a filter paper method potentially applicable to mass and high‐risk urinary screenings for Fabry disease
Notice bibliographique
Résumé
Fabry disease is an X-linked lysosomal storage disorder of glycosphingolipid catabolism resulting from a deficiency of the enzyme alpha-galactosidase A, and leading to the progressive accumulation of one biomarker, globotriaosylceramide (Gb(3)), predominantly elevated in the urine of these patients. We have developed a technique for the analysis of total Gb(3) in urine samples collected on filter paper, using liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) with a triple quadrupole instrument. Existing Gb(3) techniques being both time- and labour-intensive, this filter paper method eliminates lipid extraction, glycolipid isolation, centrifugation and evaporation steps, while maintaining sensitivity and efficiency. The stability of Gb(3) on filter paper was good for a 7-week period under different temperature conditions. Normal control values were established and the technique was tested with anonymized samples from Fabry hemizygotes and heterozygotes. The levels of total Gb(3) in all classical hemizygotes were well above the control values and all heterozygotes, except two nonexcretors, were above the reference level. The proposed novel filter paper method favours the collection, storage and shipment of samples. It is simple and efficient for a feasibility study, potentially applicable to the determination of total urinary Gb(3) in the newborn population as part of a screening programme, and could also be used in high-risk screening laboratories. Since the incidence of Fabry disease is hard to establish, owing to the heterogeneous clinical expression of the visible phenotype, this feasibility study could help determine its actual incidence in the Quebec population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».