Alterations of centromere positions in nuclei of immortalized and malignant mouse lymphocytes
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The three-dimensional (3D) positions of centromeres have been studied in several cell systems. However, data on centromere positions during cellular transformation remain elusive. This study has focused on mouse lymphocytes and investigated the centromere positions in primary, immortalized, and tumor cells. METHODS: Eighty-to-ninety z-slices of each mouse lymphocyte nucleus were acquired using a sampling distance of 107 nm in the xy plane and 200 nm along z for each z-stack, using an Axioplan 2 microscope, an AxioCam HR CCD, a 63x/1.4 oil objective, and the Axiovision 3.1 software (Carl Zeiss, Canada). A constrained iterative algorithm (Schaefer et al., J Microsc 2001;204:99-107) was used for deconvolution. Centromere positions in 3D images were analyzed using CentroView, a program we developed to measure nuclear centromere positions. RESULTS: Using CentroView we determined the positions of centromeres in primary lymphocytes, immortalized and malignant mouse B cells. We show that centromeres exhibit altered nuclear positions in immortalized and malignant B cells. These changes are independent of previously described cell cycle-dependent centromere dynamics. CONCLUSIONS: The 3D positions of centromeres are altered during cellular transformation. In lymphocytes, centromeres are found in more central nuclear positions following immortalization and transformation. These nuclear changes reflect structural remodeling of mammalian nuclei during oncogenesis and may impact on the structural organization of chromosomes. How centromeric changes are linked to nuclear remodeling can now be quantitatively examined using the tools of this study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».