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Enregistrement W1983087060 · doi:10.1139/g08-022

Assessment of molecular diversity at QTLs for preharvest sprouting resistance in wheat using microsatellite markers

2008· article· en· W1983087060 sur OpenAlexaffvenueabout
Bourlaye Fofana, Gavin Humphreys, Golam Rasul, Sylvie Cloutier, Daryl Somers

Notice bibliographique

RevueGenome · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPreharvestGermplasmMicrosatelliteSproutingAlleleGenetic diversityQuantitative trait locusMolecular markerAgronomyGeneticsHorticultureGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breeding for preharvest sprouting (PHS) resistance is of great interest in wheat-growing areas where high rainfall occurs during grain ripening and harvest. We have characterized 32 wheat accessions using 33 microsatellite markers flanking PHS quantitative trait loci (QTLs) previously identified on group 3, 4, 5, and 6 chromosomes of hexaploid wheat. A total of 229 alleles, with an average of 6.94 alleles per marker, were observed among the 32 wheat lines. The polymorphic information content (PIC) was estimated and ranged between 0.25 and 0.90, with an average of 0.67. A cluster analysis revealed 3 main clusters and 3 singlet wheat lines, which is in agreement with pedigree-based relationships, seed coat colour, and origin. Canadian wheat accessions were subdivided into 4 sub-clusters based on pedigree and wheat classes. Grouping of preharvest sprouting germplasm into clusters was consistent with cluster-specific allele diversity observed in the PHS-resistant lines AUS1408, Red-RL4137, White-RL4137, and Kenya321. The implications of these findings in white wheat breeding for PHS tolerance are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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