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Enregistrement W1983131905 · doi:10.1159/000097660

Von Willebrand Factor Short Sequence Repeat Locus 2 (Intron 40) Consists of Three Polymorphic Subloci

2006· article· en· W1983131905 sur OpenAlexaff
Maha Othman, Hisham S. Elbatarny, Christopher D. Byrne, Denise O’Shaughnessy

Notice bibliographique

RevueActa Haematologica · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLocus (genetics)GeneticsBiologyAlleleIntronGeneMicrosatellitePolymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Currently, identification of alleles within the short sequence repeat locus (SSR locus) of intron 40 of the von Willebrand factor gene (previously known as VNTR II) is based on the size of PCR products that only predicts a certain number of repeats. Through cloning and sequencing, we demonstrated the complexity of nucleotide sequence structure of this region by describing three polymorphic tetranucleotide repeat subloci SSR 'a', SSR 'b' and SSR 'c' within the same originally described locus: the original TCTA (9-14 repeats), a small TCTA repeat locus (2 or 3 repeats) located at the 5' end and 30 nucleotides upstream from the original locus and a TGTA repeat locus (5 or 6 repeats), adjacent to the 2/3 repeat locus. Sequencing of 54 VWF alleles has revealed 14 different sequence combinations in this region while the size variability in the region only amounts to a 7-allele system. While the determination of VNTR alleles by PCR remains a practical methodology in linkage analysis, this may not be applicable in forensic medicine since not all alleles of identical length based on PCR are the same. Our study reveals the important implication of the identification of SSR 2 subloci and concludes that at least in some situations, there may be a necessity to take into consideration these polymorphic subloci.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil0,781

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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