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Enregistrement W1983376659 · doi:10.6026/97320630002078

Photosensitivity in Smith-Lemli-Opitz syndrome: A flux balance analysis of altered metabolism

2007· article· en· W1983376659 sur OpenAlexaff
Bell Raj Eapen

Notice bibliographique

RevueBioinformation · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensSKiN Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSmith–Lemli–Opitz syndromePhotosensitivityFlux (metallurgy)CholesterolEnzymeReductaseMedicineChemistryBiochemistryInternal medicinePhysics7-Dehydrocholesterol reductase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ultraviolet A photosensitivity is a debilitating symptom associated with the metabolic disorder Smith-Lemli-Opitz syndrome (SLOS). SLOS is a manifestation of the deficiency of 7-dehydrocholesterol reductase, an enzyme involved in the cholesterol biosynthesis. As a result several abnormal intermediary compounds are formed among which Cholesta 5, 7, 9(11)-trien-3beta-ol is the most likely cause of photosensitivity. The effect of various drugs acting on cholesterol biosynthetic pathway on SLOS is not clear as clinical trials are not available for this rare disorder. A Flux Balance Analysis (FBA) has been carried out using the software CellNetAnalyzer or FluxAnalyzer to gain insight into the probable effects of various drugs acting on cholesterol biosynthetic pathway on photosensitivity in SLOS. The model consisted of 44 metabolites and 40 reactions. The formation flux of Cholesta 5, 7, 9(11)-trien-3beta-ol increased in SLOS and remained unchanged on simulation of the effect of miconazole and SR31747. However zaragozic acid can potentially reduce the flux through the entire pathway. FBA predicts zaragozic acid along with cholesterol supplementation as an effective treatment for photosensitivity in SLOS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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