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Enregistrement W1983388631 · doi:10.1111/j.1572-0241.2005.40979.x

The Role of Cytokine Gene Polymorphisms in Determining Disease Susceptibility and Phenotype in Inflammatory Bowel Disease

2005· article· en· W1983388631 sur OpenAlexafffund
Michael J Cantor, Peter Nickerson, Çharles N. Bernstein

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Association of GastroenterologyAbbott Laboratories
Mots-clésMedicineInflammatory bowel diseasePhenotypeDiseaseClinical phenotypeGeneCytokineImmunologyGeneticsPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: Emerging data indicate that alterations in cytokine synthesis may play a role in inflammatory bowel disease (IBD) pathogenesis. The differential production of cytokines has been linked to single nucleotide polymorphisms in gene promoter regions, signal sequences, and gene introns. The aim of this study was to assess the relationship between polymorphisms involving five cytokine genes (TNF-alpha, TGF-beta, IL-10, IL-6, and IFN-gamma), and IBD susceptibility and disease phenotype. METHODS: Cytokine genotyping was performed utilizing polymerase chain reaction. The specific gene polymorphisms that were probed for included: -1082(G/A), -819(T/C), and -592(A/C) in the IL-10 promoter, -308(G/A) in the TNF-alpha promoter, codon 10 (T/C), and codon 25 (G/C) of the TGF-beta signal sequence, +874(T/A) of intron 1 of IFN-gamma, and -174(C/G) in the IL-6 promoter. RESULTS: A total of 193 IBD patients (138 Crohn's disease (CD) and 55 ulcerative colitis (UC)) and 92 controls were evaluated. No association between IBD, UC, or CD susceptibility and the cytokine gene polymorphisms were found. Patients with ileocolonic CD were more likely to possess the IL-6 -174 GG genotype compared to those with nonileocolonic disease (p= 0.006). Patients with ileal CD were more likely to possess the IL-6 -174 GC genotype compared to those with nonileal disease (p= 0.0004). An increased number of CD patients with isolated colonic disease possessed the IL-6 -174 CC genotype compared to those with nonisolated colonic disease (p= 0.032). CONCLUSION: The cytokine gene polymorphisms studied here do not appear to influence IBD susceptibility. There does, however, appear to be an influence on disease phenotype, particularly on CD site.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations94
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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