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Enregistrement W1983396449 · doi:10.4141/p06-152

Characterization and comparative analysis of three low molecular weight glutenin C-subunit genes isolated from <i>Aegilops tauschii</i>

2007· article· en· W1983396449 sur OpenAlexaffvenue
Yuhe Pei, Aili Wang, Xueli An, Xiaohui Li, Yanzhen Zhang, Xiu-Qiang Huang, Yueming Yan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGluteninAegilops tauschiiBiologyGeneGeneticsProtein subunitAegilopsPhylogenetic treeAmino acidEndospermMolecular biologySequence analysisIntronGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three low molecular weight glutenin subunit (LMW-GS) genes from T121, T128 and T132 accessions of Aegilops tauschii (DD, 2n = 2x = 14) were amplified using allelic-specific PCR primers. The amplified products with a size of about 900 bp were cloned and sequenced. Three complete coding sequences of LMW-GS with 918 bp, 921 bp and 918 bp were obtained and named as LMW-T121, LMW-T128, LMW-T132, respectively. Each gene contained a complete open reading frame and had no introns. The deduced amino acid sequences showed that all belonged to LMW-m type subunit with a predicted molecular weight of about 32 kDa, corresponding to the size of LMW C-subunits. All three subunits possessed eight cysteine residues and had greater homology with previously characterized LMW-m subunits from bread wheat and related species than LMW-s or LMW-i sequences. Some amino acid substitutions and insertion/deletion variations among the sequences were detected. The corresponding three C-subunits in seed endosperm encoded by LMW-T121, LMW-T128, LMW-T132, respectively, were identified and confirmed by SDS-PAGE, MALDI-TOF-MS and direct N-terminal amino acid sequencing. Phylogenetic analysis demonstrated that LMW-m and LMW-s type subunit genes possessed higher identity and they were obviously separated from LMW-i type subunit genes. The LMW-m type might be the primitive form while the LMW-s and LMW-i types are variant forms. Key words: Aegilops tauschii, LMW-GS, AS-PCR, phylogenetic analysis

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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