Genetic variation among pathotypes of<i>Verticillium dahliae</i>Kleb. from cotton in western Turkey revealed by AFLP
Notice bibliographique
Résumé
Cotton (Gossypium hirsutum L.) is crucial for the textile industry worldwide. Among the diseases attacking cotton, Verticillium wilt caused by Verticillium dahliae Kleb. is the most significant. Isolates of V. dahliae can be classified into defoliating and non-defoliating pathotypes. Thirty-two isolates of the non-defoliating pathotype and one isolate of a virulent, defoliating pathotype were analysed by the amplified fragment length polymorphism (AFLP) method. Three hundred and forty AFLP fragments were obtained with nine primer combinations. The number of total bands per primer pair ranged from 16 to 81, with an average of 37.7. The average polymorphism information content (PIC) value for the AFLP products was 0.50. Using the genotypic data, genetic distance analysis was performed. The maximum variation was found between isolates (Vd11) Nazilli and (Vd16) Soke, at a value of 0.79 and the minimum variation was found between isolates (Vd20) Aydin and (Vd14) Soke, at 0.24. The unweighted paired group method with arithmetic averages cluster analysis (UPGMA) was used to discriminate the V. dahliae isolates into five subgroups. Defoliating pathotypes (Vd33) from Soke province formed a single subgroup. As a result, it was found that there was significant variation among Verticillium isolates. AFLP analysis is an efficient and effective marker technology for determining genetic relationships among Verticillium isolates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».