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Enregistrement W1983574014 · doi:10.1021/jp0617571

Conformational Properties of a Phototautomerizable Nucleoside Biomarker for Phenolic Carcinogen Exposure

2006· article· en· W1983574014 sur OpenAlexaff
Christopher K. McLaughlin, Dean R. Lantero, Richard A. Manderville

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePhotochemistry and Electron Transfer Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryAdductIntramolecular forceMoietyDeoxyguanosineTautomerHydrogen bondStereochemistryMoleculeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have characterized the conformational properties of the C8-deoxyguanosine (C8-dG) nucleoside adduct, 8-(2"-hydroxyphenyl)-2'-dG (1), which is a potential biomarker for exposure to phenolic carcinogens. Adduct 1 possesses the unique ability to phototautomerize, through an excited-state intramolecular proton transfer (ESIPT) process, to generate its keto form. This tautomerization depends on the presence of an intramolecular hydrogen (H)-bond between the phenolic OH and the imine nitrogen (N7) and has permitted insight into the equilibrium ground states of adduct 1. The results of our studies demonstrate that adduct 1 undergoes an ESIPT despite preferring a nonplanar "twisted" conformation that is imposed by the deoxyribose (dR) sugar moiety. Interestingly, a planar conformation of adduct 1 is also formed in certain aprotic solvents due to the anchoring effect of the intramolecular H-bond. Our results provide a basis for future studies aimed at determining the conformations of adduct 1 within DNA that will aid in our understanding of phenol-mediated carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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