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Enregistrement W1983574014 · doi:10.1021/jp0617571

Conformational Properties of a Phototautomerizable Nucleoside Biomarker for Phenolic Carcinogen Exposure

2006· article· en· W1983574014 sur OpenAlexaff
Christopher K. McLaughlin, Dean R. Lantero, Richard A. Manderville

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePhotochemistry and Electron Transfer Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryAdductIntramolecular forceMoietyDeoxyguanosineTautomerHydrogen bondStereochemistryMoleculeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have characterized the conformational properties of the C8-deoxyguanosine (C8-dG) nucleoside adduct, 8-(2"-hydroxyphenyl)-2'-dG (1), which is a potential biomarker for exposure to phenolic carcinogens. Adduct 1 possesses the unique ability to phototautomerize, through an excited-state intramolecular proton transfer (ESIPT) process, to generate its keto form. This tautomerization depends on the presence of an intramolecular hydrogen (H)-bond between the phenolic OH and the imine nitrogen (N7) and has permitted insight into the equilibrium ground states of adduct 1. The results of our studies demonstrate that adduct 1 undergoes an ESIPT despite preferring a nonplanar "twisted" conformation that is imposed by the deoxyribose (dR) sugar moiety. Interestingly, a planar conformation of adduct 1 is also formed in certain aprotic solvents due to the anchoring effect of the intramolecular H-bond. Our results provide a basis for future studies aimed at determining the conformations of adduct 1 within DNA that will aid in our understanding of phenol-mediated carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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