POPK-1/Sad-1 kinase is required for the proper translocation of maternal mRNAs and putative germ plasm at the posterior pole of the ascidian embryo
Notice bibliographique
Résumé
Maternal mRNAs localized to specific regions in eggs play important roles in the establishment of embryonic axes and germ layers in various species. Type I postplasmic/PEM mRNAs, which are localized to the posterior-vegetal cortex (PVC) of fertilized ascidian eggs, such as the muscle determinant macho-1 mRNA, play key roles in embryonic development. In the present study, we analyzed the function of the postplasmic/PEM RNA Hr-POPK-1, which encodes a kinase of Halocynthia roretzi. When the function of POPK-1 was suppressed by morpholino antisense oligonucleotides, the resulting malformed larvae did not form muscle or mesenchyme, as in macho-1-deficient embryos. Epistatic analysis indicated that POPK-1 acts upstream of macho-1. When POPK-1 was knocked down, localization of every Type I postplasmic/PEM mRNA examined, including macho-1, was perturbed, showing diffuse early distribution and eventual concentration into a smaller area. This is the probable reason for the macho-1 dysfunction. The postplasmic/PEM mRNAs such as macho-1 and Hr-PEM1 are co-localized with the cortical endoplasmic reticulum (cER) and move with it after fertilization. Eventually they become highly concentrated into a subcellular structure, the centrosome-attracting body (CAB), at the posterior pole of the cleaving embryos. The suppression of POPK-1 function reduced the size of the domain of concentrated cER at the posterior pole, indicating that POPK-1 is involved in the movement of postplasmic/PEM RNAs via relocalization of cER. The CAB also shrank. These results suggest that Hr-POPK-1 plays roles in concentration and positioning of the cER, as well as in the concentration of CAB materials, such as putative germ plasm, in the posterior blastomeres.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».