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Enregistrement W1983722060 · doi:10.1242/dev.02049

POPK-1/Sad-1 kinase is required for the proper translocation of maternal mRNAs and putative germ plasm at the posterior pole of the ascidian embryo

2005· article· en· W1983722060 sur OpenAlexfundno aff
Yoriko Nakamura, Kazuhiro W. Makabe, Hiroki Nishida

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Ecology and Invasive Species
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésBiologyCell biologyMorpholinoEndoplasmic reticulumEmbryoCytoplasmEmbryonic stem cellEmbryogenesisGeneticsZebrafishGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maternal mRNAs localized to specific regions in eggs play important roles in the establishment of embryonic axes and germ layers in various species. Type I postplasmic/PEM mRNAs, which are localized to the posterior-vegetal cortex (PVC) of fertilized ascidian eggs, such as the muscle determinant macho-1 mRNA, play key roles in embryonic development. In the present study, we analyzed the function of the postplasmic/PEM RNA Hr-POPK-1, which encodes a kinase of Halocynthia roretzi. When the function of POPK-1 was suppressed by morpholino antisense oligonucleotides, the resulting malformed larvae did not form muscle or mesenchyme, as in macho-1-deficient embryos. Epistatic analysis indicated that POPK-1 acts upstream of macho-1. When POPK-1 was knocked down, localization of every Type I postplasmic/PEM mRNA examined, including macho-1, was perturbed, showing diffuse early distribution and eventual concentration into a smaller area. This is the probable reason for the macho-1 dysfunction. The postplasmic/PEM mRNAs such as macho-1 and Hr-PEM1 are co-localized with the cortical endoplasmic reticulum (cER) and move with it after fertilization. Eventually they become highly concentrated into a subcellular structure, the centrosome-attracting body (CAB), at the posterior pole of the cleaving embryos. The suppression of POPK-1 function reduced the size of the domain of concentrated cER at the posterior pole, indicating that POPK-1 is involved in the movement of postplasmic/PEM RNAs via relocalization of cER. The CAB also shrank. These results suggest that Hr-POPK-1 plays roles in concentration and positioning of the cER, as well as in the concentration of CAB materials, such as putative germ plasm, in the posterior blastomeres.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,319
Score d'incertitude au seuil0,835

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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