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Enregistrement W1983784135 · doi:10.1042/bj3510765

Novel consensus sequence for the Golgi apparatus casein kinase, revealed using proline-rich protein-1 (PRP1)-derived peptide substrates

2000· article· en· W1983784135 sur OpenAlexfundno aff
Anna Maria Brunati, Oriano Marin, Alfredo BISINELLA, Alessandro Salviati, Lorenzo A. Pinna

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmino Acid Enzymes and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoMinistero della SaluteGiovanni Armenise-Harvard Foundation
Mots-clésCasein kinase 1PeptideConsensus sequenceGolgi apparatusCaseinPeptide sequenceBiologyCasein kinase 2BiochemistryProlineSequence (biology)KinaseProtein kinase AAmino acidEndoplasmic reticulumMitogen-activated protein kinase kinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have shown that the Golgi apparatus casein kinase (G-CK) recognizes phosphoacceptor sites specified by the triplet SXE/Sp, which is found in several phosphoproteins, besides casein itself. In the present study, we report that G-CK can phosphorylate, with comparable efficiency, sequences surrounding Ser-22 of salivary proline-rich protein-1 (PRP1), which do not conform to the SXE/Sp motif. By using a series of peptide substrates derived from the PRP1 Ser-22 site, we also have shown that the optimal consensus sequence recognized by G-CK in this case was SXQXX(D/E)3, where the acidic residues at positions n+5 to n+7 and, to a lesser extent, the glutamine residue at position n+2 are the critical determinants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,823

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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