The phytopathogenic fungi Leptosphaeria maculans and Leptosphaeria biglobosa: chemotaxonomical characterization of isolates and metabolite production in different culture media
Notice bibliographique
Résumé
Previous molecular chemotaxonomic analyses of isolates of the plant pathogenic fungus Leptosphaeria maculans (Desm.) Ces. et de Not. (asexual stage Phoma lingam (Tode ex Fr.) Desm.) in a chemically defined medium suggested that this species complex was composed of at least three distinct groups. Subsequently, a group within L. maculans was classified as Leptosphaeria biglobosa, on the basis of morphologic characteristics and the lack of sexual crossing. To obtain clarification regarding the metabolite profiles of the various groups or species of blackleg fungi, the objectives of this work were (i) to determine the chemical structures of metabolites produced by Canadian V isolates and Polish-type isolates in potato dextrose broth (PDB) and (ii) to determine the chemotaxonomic relationship among French isolates of L. biglobosa and among Canadian W isolates and Thlaspi isolates of L. maculans. Here, we report for the first time that Canadian V isolates grown in PDB produced 2,4-dihydroxy-3,6-dimethylbenzaldehyde, a metabolite never reported from L. maculans, but none of the usual phytotoxins (sirodesmins). In addition, we report a new metabolite, 2-[2-(5-hydroxybenzofuranyl)]-3-(4-hydroxyphenyl)propanenitrile, from Polish-type isolates of L. maculans grown in PDB and the metabolite profiles of 16 Thlaspi isolates. The metabolite profiles of Thlaspi isolates indicate that these are part of two distinct groups, the Polish W group and the Canadian W group, i.e., L. biglobosa. Finally, we demonstrate that the metabolite profiles of the French isolates classified as L. biglobosa are similar to those of Canadian W isolates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».