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Enregistrement W1983841377 · doi:10.1074/jbc.m109508200

Isolation and Characterization of XKaiso, a Transcriptional Repressor That Associates with the Catenin Xp120 in Xenopus laevis

2002· article· en· W1983841377 sur OpenAlexaff
Si Wan Kim, Xiang Fang, Hong Ji, Alicia F. Paulson, Juliet M. Daniel, Malgorzata Ciesiolka, Frans van Roy, Pierre D. McCrea

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésXenopusIsolation (microbiology)CateninCell biologyRepressorChemistryBiologyWnt signaling pathwayBiochemistryGeneBioinformaticsTranscription factorSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Armadillo family of catenin proteins function in multiple capacities including cadherin-mediated cell-cell adhesion and nuclear signaling. The newest catenin, p120(ctn), differs from the classical catenins and binds to the membrane-proximal domain of cadherins. Recently, a novel transcription factor Kaiso was found to interact with p120(ctn), suggesting that p120(ctn) also possesses a nuclear function. We isolated the Xenopus homolog of Kaiso, XKaiso, from a Xenopus stage 17 cDNA library. XKaiso contains an amino-terminal BTB/POZ domain and three carboxyl-terminal zinc fingers. The XKaiso transcript was present maternally and expressed throughout early embryonic development. XKaiso's spatial expression was defined via in situ hybridization and was found localized to the brain, eye, ear, branchial arches, and spinal cord. Co-immunoprecipitation of Xenopus p120(ctn) and XKaiso demonstrated their mutual association, whereas related experiments employing differentially epitope-tagged XKaiso constructs suggest that XKaiso additionally self-associates. Finally, reporter assays employing a chimera of XKaiso fused to the GAL4 DNA binding domain indicate that XKaiso is a transcriptional repressor. These data suggest that XKaiso functions throughout development and that its repressor functions may be most apparent in the context of neural tissues. The significance of the XKaiso-p120(ctn) interaction has yet to be determined, but it may include transducing information from cadherin-mediated cell-cell contacts to transcriptional processes within the nucleus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,214

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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